而在宇宙的其他角落，一些小型文明开始对联合组织的领导地位产生质疑。他们认为，联合组织在应对神秘舰队威胁时，未能提前做好充分准备，导致许多星系遭受了不必要的损失。这些小型文明开始联合起来，成立了一个名为“独立联盟”的组织，要求在宇宙事务中有更多的话语权和决策权，甚至提出要重新审视联合组织的权力架构。
联合组织意识到了这些潜在危机，迅速做出回应。他们召开了一次全宇宙文明代表大会，邀请各个文明的领导者和代表参加。在大会上，联合组织详细汇报了应对神秘舰队威胁的全过程，包括对神秘舰队的侦察、科研突破以及战术制定等方面的工作。同时，联合组织也坦诚地承认了在应对过程中存在的不足，并表示将进一步加强自身建设，提升应对危机的能力。
针对“独立联盟”提出的诉求，联合组织表示理解，并承诺将在未来的决策过程中，更加广泛地听取各文明的意见和建议，优化权力架构，确保每个文明的利益都能得到充分保障。联合组织还强调，宇宙面临的威胁是共同的，只有各文明团结一心，才能共同应对未来的挑战。
在大会的交流环节，各文明代表就宇宙的未来发展、资源分配、科技合作等问题展开了深入讨论。一些文明提出了建立宇宙科技共享平台的设想，以便各文明能够更便捷地获取和交流先进技术；还有一些文明建议成立一个专门的宇宙危机预警机构，提前监测和预警潜在的威胁。
这次大会虽然在一定程度上缓解了各文明之间的矛盾，但联合组织深知，要真正解决这些潜在危机，还需要付出更多的努力。宇宙的局势依然复杂多变，神秘舰队背后的未知势力、各文明之间的利益分歧以及对联合组织领导地位的质疑，都如同一颗颗定时炸弹，随时可能引发新的危机。联合组织必须在战后的重建与发展中，谨慎应对这些问题，努力维护宇宙的和平与稳定，为各文明创造一个安全、繁荣的未来。