联合小队全身心地投入到宇宙防御联军的组建工作中，然而，一开始便遭遇了重重困难。不同星系的文明在科技发展水平、军事理念以及文化传统上差异巨大，这使得各方在联军的组织架构、训练方式以及指挥权分配等关键问题上难以达成共识。
来自科技高度发达的赛博星系代表，坚持以先进的人工智能系统作为联军的指挥核心，认为这样能实现最精准高效的作战决策。但崇尚自然力量的伊甸星系代表则坚决反对，他们坚信只有通过神秘守护者与元素使者的精神指引和元素力量协调，才能让联军真正发挥出强大的战斗力。而以勇猛战斗风格着称的战神星系代表，主张将指挥权交给最具战斗经验的特战队员，认为实战经验才是决定战争胜负的关键。
文化差异也在不断引发摩擦。一些注重个体自由的文明，对严格统一的训练模式极为抵触，认为这会束缚成员的个性和创造力；而强调集体主义的文明，则难以理解某些文明对个人隐私和特殊权益的过度重视。
科研人员在协调各方技术融合时同样举步维艰。不同文明的科技体系犹如复杂的拼图，难以找到完美的契合点。例如，赛博星系的能量护盾技术基于微观粒子的重组，而伊甸星系的防护法术依赖于自然元素的共鸣，两种技术在原理上大相径庭，想要整合到一起困难重重。
就在联合小队感到一筹莫展之时，一系列神秘的袭击事件打破了僵持的局面。一些小型星系接连遭到不明势力的攻击，这些袭击者行动迅速，手段残忍，而且具备强大的反侦察能力。被袭击的星系瞬间陷入混乱，居民们流离失所。
这些袭击事件让各个文明深刻意识到黑暗威胁的紧迫性。原本争论不休的各方开始冷静下来，重新审视组建联军的重要性。联合小队抓住这个转机，积极斡旋。